Xu Chengranin ryhmä School of Basic Medical Sciencesissä, Pekingin yliopistossa, Pekingin yliopiston ja Tsinghuan yhteisessä biotieteiden keskuksessa on julkaissut tutkimuspaperin, jonka otsikko on: Hepatoblastien erilaistumisen oletus- ja ohjatut reitit sisältävät erillisiä epigenomisia mekanismeja. Naisten hedelmällisyyden edistämisen kansallinen avainlaboratorio. Hepatoblastien erilaistumisen oletus- ja suunnatut reitit sisältävät erilliset epigenomiset mekanismit.
Tutkimus paljastaa hepatoblastien erilaistumisen epigenomiset mekanismit parenkymaalisiksi soluiksi ja kolangiosyyteiksi maksan kehityksen aikana.
Solujen kohtalopäätöksiä säätelevät useat geneettiset ja epigeneettiset kaskadit, mukaan lukien geenin transkriptio, kromatiinin saatavuus ja histonimuunnokset. Vaikka multi-omiikka-analyysejä on käytetty soluidentiteetin määrittämiseen kehityksen aikana, multi-omics-lähestymistapojen käytön tarkkuutta solujen erilaistumisen kehityspolkujen paljastamiseksi in vivo ja eri lähestymistapojen välisiä suhteita ei ole tutkittu tehokkaasti, koska yksinkertainen ja tehokas järjestelmä. Maksa on tärkeä aineenvaihduntaelin, ja sen tärkeimmät solutyypit, maksan parenkymaaliset solut ja kolangiosyytit, ovat peräisin bipotentiaalisista hepatoblasteista kehityksen aikana.
Xu Chengeranin ryhmän aiemmassa työssä ehdotettiin uutta "oletussäätely" -mallia hepatoblastien erilaistumisesta, eli hepatoblastien kehittyminen parenkymaalisiksi soluiksi on oletusarvoinen solun kohtalon prosessi, kun taas erilaistumista kolangiosyyteiksi säännellään voimakkaasti. Käyttämällä tätä yksinkertaista ja helppokäyttöistä maksasolujen erilaistumisjärjestelmää in vivo, ryhmä tutki erilaisten epigeneettisten modifikaatioiden yhteyttä solujen erilaistumis- ja kehitysreitteihin sekä säätelymekanismeja.
Ryhmä valitsi joukon aikapisteitä hiiren hepatoblastien kehittymisestä maksan parenkymaalisiin soluihin ja kolangiosyytteihin ja analysoi maksan linjasolujen dynaamisia epigeneettisiä piirteitä eri kehitysjaksoilla käyttämällä multi-omiikkatekniikoita, kuten RNA-seq, ATAC-seq ja histonimuunnoksiin liittyvä ChIP-seq. Tulokset osoittivat, että dynaamiset muutokset transkriptomissa, kromatiinin saavutettavuudessa ja promoottoriin liittyvissä histonimuunnelmissa H3K4me3 ja H3K27me3 voisivat tehokkaasti karakterisoida "oletussäädeltyä" hepatoblastien erilaistumisen reittiä, kun taas tehostajiin liittyvät histonimuunnokset H3K4me1 ja H3K27ac eivät pystyneet luonnehtimaan tätä reittiä tehokkaasti. . polku. Geneettiset tutkimukset osoittivat, että promoottoriin liittyvillä H3K27me{22}}modifioivilla entsyymeillä Ezh2 ja Jmjd3 on päinvastaiset säätelyroolit hepatoblastien ja kolangioblastien erilaistumisessa, eikä niillä ole merkittävää vaikutusta hepatoblastien ja parenkymaalisten solujen erilaistumiseen, kun taas aktiiviseen tehostajaan liittyvällä histoniparenkymaalitransferaasin p30-asetyylitransferaasia moduloi. ja kolangioblastien kypsyminen hepatoblastien erilaistumisen jälkeen. Siten promoottoriin ja tehostajaan liittyvä epigeneettinen säätely hepatoblastien kehityksessä jakavat roolinsa säädelläkseen solujen erilaistumisprosessia ja kypsymisprosessia.
Tämä tutkimus ei ainoastaan luo paradigmaa multi-omiikan käytölle solun kohtalon siirtymien ja kehityksen ratkaisemiseksi, vaan tarjoaa myös tärkeää kehitysbiologiatietoa maksasolujen ohjaaman erilaistumisen optimoimiseksi in vitro.
Chengran Xu, Pekingin yliopiston lääketieteen peruskoulun professori ja yhteisen biotieteiden keskuksen tutkija, on vastaava kirjoittaja; Li Yang, Pekingin yliopiston lääketieteen peruskoulun tutkijatohtori, ja Xin Wang, Biotieteiden korkeakoulun tohtoriopiskelija, ovat ensimmäisiä kirjoittajia; Xinxin Yu ja Bichen Zhou, Pekingin yliopiston lääketieteellisen perustieteiden korkeakoulun tutkijatohtorit sekä professori Joyce ja Lu Yang, Pekingin yliopiston biotieteiden korkeakoulun, Joint Center for Life Sciences ja McGowan Institute for Brain Sciencen professorit IDG:stä, opiskella.
